芹菜菌核病可為害葉片、葉柄和莖。一般葉片首先發病，呈暗色污斑，潮濕時表面密生白色霉層。然后向下蔓延引起葉柄和莖發病。受害部位呈褐色水漬狀，速度大時形成軟腐，表面長出白色菌絲，最后莖組織腐爛呈纖維狀莖內中空，形成鼠糞狀黑色菌核。當前有利于該病發生，一定要引起高度注意，做到早發現，早防治，減輕損失。
發病規律
子囊孢子借風雨傳播，侵染生活力衰弱的老葉，帶病的葉片與健壯葉、莖接觸可使菌絲蔓延傳播。高溫高濕，有利于該病的發生和流行。芹菜連茬或與易發生菌核病的十字花科蔬菜連茬容易發病。雨季排水不良，偏施氮肥發病重。
防治方法
1.農業防治。實行三年以上輪作。播前進行種子消毒。雨季及時排水，降低田間濕度。及時把病葉清除出田間，集中深埋，嚴防病菌擴散。
2.藥劑防治。發病初期開始噴灑70%甲基托布津可濕性粉劑600倍液，或50%多菌靈可濕性粉劑500倍液，或65%甲霉靈可濕性粉劑1000倍液，5～7天噴1次，連續防治2～3次。以上農藥交替使用，可避免產生抗藥性。