第六紀檢監(jiān)察室至第十二紀檢監(jiān)察室：監(jiān)督檢查聯(lián)系地區(qū)省級領導班子及中管干部遵守和執(zhí)行黨章以及其他黨內(nèi)法規(guī)，遵守和執(zhí)行黨的路線方針政策和決議、國家法律法規(guī)等方面的情況；監(jiān)督檢查聯(lián)系地區(qū)落實黨風廉政建設主體責任、監(jiān)督責任的情況；承辦聯(lián)系地區(qū)中管干部的違紀違法案件和其他比較重要復雜案件的初核、審查；綜合、協(xié)調(diào)、指導聯(lián)系地區(qū)的紀檢監(jiān)察工作等。其中，六室聯(lián)系北京市、天津市、河北省、山西省，七室聯(lián)系上海市、浙江省、安徽省、福建省、江西省，八室聯(lián)系湖南省、廣東省、廣西壯族自治區(qū)、海南省及中央人民政府駐香港特別行政區(qū)聯(lián)絡辦公室、中央人民政府駐澳門特別行政區(qū)聯(lián)絡辦公室，九室聯(lián)系陜西省、甘肅省、青海省、寧夏回族自治區(qū)、新疆維吾爾自治區(qū)及新疆生產(chǎn)建設兵團，十室聯(lián)系內(nèi)蒙古自治區(qū)、遼寧省、吉林省、黑龍江省，十一室聯(lián)系重慶市、四川省、貴州省、云南省、西藏自治區(qū)，十二室聯(lián)系江蘇省、山東省、河南省、湖北省。

案件審理室：審理委部直接檢查處理和省（部）級黨組織、政府（部門）報批或備案的案件；按照管理權限承辦黨員、監(jiān)察對象的申訴案件；承擔監(jiān)察部的行政復議工作等。

紀檢監(jiān)察干部監(jiān)督室：監(jiān)督檢查紀檢監(jiān)察系統(tǒng)干部遵守和執(zhí)行黨章以及其他黨內(nèi)法規(guī)，遵守和執(zhí)行黨的路線方針政策和決議、國家法律法規(guī)等方面的情況；按照管理權限受理有關紀檢監(jiān)察干部違紀違法問題的舉報，負責問題線索初核及案件審查工作等。

國際合作局（國家預防腐敗局辦公室）：承擔國際交流與合作事宜；承擔國家預防腐敗局辦公室的日常工作，組織《聯(lián)合國反腐敗公約》實施工作；歸口管理機關外事工作等。

機關事務管理局：負責機關后勤管理和服務工作；負責機關及直屬單位財務、國有資產(chǎn)管理和安全保衛(wèi)工作等。

機關黨委：負責機關黨的建設；負責機關日常紀律作風建設和黨員思想政治工作；領導機關紀委和工會、共青團、婦委會工作等。

離退休干部局：負責機關離退休干部（職工）的思想政治工作、黨組織建設工作以及服務與管理工作等。